Annotated gene sequence

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TAGTTTAGTGGTAAAAGAAGCGAAGGTGGGTGAACCAGAGGTAAAGGAAGAGAAGGTAAAGGAAGAGGTAATGGACTGGTCAGAAGTGAAGGAAGAGAAG
GATAACTTGGAGATAAAACAGGAGGAGAAGTTTGTTGGTCAATGCATAAAAGAGGAATTGATGCATGGAGAGTGTGTAAAAGAAGAGAAGGATTTCCTGA
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GTAGAGACAGGGTTGCGCTCTTTCGCCCAGGCTGGTCTCAAATTTGTGGCCTCAAGCAATCCTTCCACCTCAGACTCCAAAGCATTGGGATTACAGGCAT
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AGTAGAACCTCACTAAACGGAAAGGCTGTACAACGCACCGTCTAGCCACAGGAGAACTAATCTTCTATCAGTTGCCCTTTCTTCTTTGGAGTTTTTATGT
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GTAGTTGATCCAGTTTGTTTCCCTGTAGCAAGTAGTGGGATTTGGGTTTCATGACATATAATTAAAATGTTAATCACATAACTATAATGCCAACAATTTT
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ATCATATACTGTTATGGTTTGAATATAGTTTGTTCCTACCAAAACTCATGTTGAAATTAGATTCCCCATGTGCTAGTGTTGGGAGGCAGAGCCTAATGGA
AGGTGTTTGGGTCATGGGGGCAGATAGATCCCACATGAATAAACTAATGCCCTCCTACTGGGGTGAGTGAGTTCTCATTCTTGCTGTCGTGGGAATGGAT
TAGTTCTCACAAGCAAGGGTTACTAAAGAGTCTGGCTTTCTTGATTTTCTCCTTTTTGCCTCCTGCCTTCCCATGTGATCTCTTTGCACATACCTACTCC
CCTTTCACTTTGTACCAAGAGTGGAAGCAACATGAGACCCTCACCAGATACAGCTGCCCAATCTTGAGCCTTCCAGCCACCAGAATCATGAGCCAAATAA
AACTCTTTTTAAAAATAAGTTACCCAGTCTTAGATATTCTATTATAGCGACACAAAATGGACTAAGCTGTACTCTGTTGCATTAAAATGTGTTGTTTATA
TGCAAGTGACAAAAACTCAAAATAGTGTCAGCATGAAGGGCAGTTCATTGGCTTATATACAGGGAAGTCCAGGCAATGACTGGGTCCTGGGTCCAAACGT
CAAAAGCAGTCATCTTGCCATCCTACACACTTGGCTCTGATTATTTTCTTCTTTATGGATTGGTTTTCTTTTCAGATTTTCCCTTTGGGGATATTCTGTA
TGGGATGAGGAACAGTGAGGTGAGAGGATGGTGGATAACAGCAATTGACATTTTCAGCTTACCTTAGCATAACAAGGCTGAAAGCTTTTATAAAGCAAGC
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TTTTAGAAGAAAGCCAGAATGTAGGGAGCAGGTGAGGAAAGGTAGTTACTGGGAATACGAAAGTAACACATTCATTGCACCCTGTTTGAATTTGAGTAGC
AAGAAGTTTCTGATTTGTACTAACAGAAGGAGTAAAGTTCAGATTTAATCTGCAAGTCTTGATTGTTTTTAACTAGAGATTTTAATCTCTTCTTCTTATT
ATTGCTGCTTTGAGTTGCCATTATAGGTTTTTGGATTTTTTTTTTAATGCCATCCATTTTTATTTGACATCATGTTGTTGCTAGTTTGAGCAGATGCACA
TAGCATATGTTTCCATTACCAATTTGGAAATTTTTCCCAGTGGCATCAGCATTTGAGAGATACTGATTTTGAAATTAGAGTACTAGGGGAAAATGCTTCA
AAAATGAAGACTACTTAAATAAAAATTGGCTTTAAATAAACCTTTGGGGATCTGTACTTGACTAAAAAGTATTTTCTTTAAACTTTGGTCTTTGAAAACT
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Loop counts:

4 nts: 1

Tetra-loop variants:

AUAU    1

Single bulge variants:

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U x 0 bulge: 0
C x 0 bulge: 0

1 x 1 internal loop variants:

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