Annotated gene sequence

CACCCCTCATCCAGTCTCTTCCAGCCTAGAGATCCTGGCCTACCCCTCCGCCAAAGCGCGCACTGAGTGCAAACCCCAGAGTCAATCCCTGTCCCGGCTC
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AGGTCCACCTCGAAGGGAACCGCTCCCCTCTCGTAGAGATGTTTATTTGTCCCCAAGAGATGATGGGTATTCTACTAAAGACAGCTATTCAAGCAGAGAT
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GAAACAAACAAAACTTTGGACCAAAATCCCAGTTCAAAGAAACAAAAAAAAGAGTGGAAACTATTCTATCATAACTACCCAAGGACTACTAAAAGGAAAA
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AGAACCTCCCCTTTCCCCTCCCACAATAAGACCATTTAAGTGTGTGCTAAACAACTACGGAATACTAAATAAAAAGTTTGGCCAAAACCAACCATGAAGC
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CTCTTCAATTTAGAACTTAAGATGAATTATAAAAATGATGGATATAAGTGGTAGCTCTATCTGGTGAAGTGTCTTGTCAGTAAGTGAAACATTTTTTTGT
GGTGGCTTATCCACAAACAGTTTAGTTGTAGAATAAAACTTATGAGTGACATCTGGAAAGTAACAACCATGCTAAGATGGCAAACACACTGGAAACAATT
GGGCCACTTGGCTTTCTTTTGCTGTATTGTTTTATAAGCCTGCTTTACCTCCCCGTCTTGGAAACAAGTTTTAGTTTATTGCTTTGGAGACTAGAGCCAA
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TAACATTTGCAACTAGGGATAGTAAGTACAACATTTTTAACTCTCATTTGGCAGACTACTACTAATCACAGACCACAAGGGTAATGACCAAATTTATGTG
GTTGTTACACTTCCATAGTTGTCTTAGCCGAATCCTTCCATATTCTTATGATTACTTGGGTTAAAGCTTCTGTGAGGACCTTTTGGCTCTTAAGATATCC
TAAATATTTAAAATATTTAGATATCCTAAATATAGGATATAGAGTTTGTACCAAATATGAATGAATATTGTTCAAAGCAAGGAGTATGTTAAAATGACCA
GACACCTGTTTGATAAATAGTTTACTGAACTAGCAGACGTGTGGAAAAAGAATCAGATCTTGATTCTTCTGGGTTTATACTGGTTGTAAAACAGAATGAT
ATTAGAAAATGTTTTCCTTGTTTAAGTGGTAGTTGAACATAGAACTTGGGTATTATAGATCACTTTTCACTTTTTGGAATGTTTTGTATTGAAACTTAAT
ACAACTTTAACATGGCAAAAAAAAAAAAAATCCAAAATCTATGAGATAATTTTGTTAAAGTTGGCTTGCTTGGGCGGGTGCTTGGTCCAGAGGGAGAAAA
GAAGGCATGATTTCAGAATACTCTGGCAGCTTTTTAAATTCAGCTTTATCAAGTTACAGTAAACTGTATCTGTTTAGAATTACAACTCAATGGTTATTTT
GACAGATGTATATGCCATGAAGCCACTGTCACCATCAACATGCAGAACACTTCCATCGCCCCCAAAAGATTCCTCAAGTTCCTTTGCAGTCCATCCCTCA
CGCTGCTGATTTGTCTTTGTCACCATATATTAGTTTGCTTTGTGGTGGTGTTTAGTATTTTATATAAATGGGATTGTGTAGCATGTACTTTTTTGTTTAT
GGTTTCTTTCACACACAATGACTTTGAAATTCACCAGGTTGCAGTGTATCAGTAGCTTATTCCTTTTATTGCTGAGTAGTGTCCCATTATGTGAATATGC
CATTATTTGTTTTTCTACTCACCTGTTGATGGACCTTGGGATTGTTTCCAGTTTGGGGCTACTGTGAATAAAACTGTTAGGAACATTTGTGTACAAGCCA
CTGTGTAGACATAGGTTTTCCTTTCTCTTGGGTAAATACCTACCAGTAAAATGGTTGGGTTGCATGGCAGATTTATGTTTAATAAAGTAACTGCCAAACT
GTTTGTTTTCCAAAGGGGCTATACCCTTTTATATTCCCACCAGGGTTGTATAGAGTTCCAACTGCCAACACTCAGTTTTCAGCCATTCTGATGGGAATCT
AGTGGTATCTCATTGTGGTTTTATTTTCATTTCCCCGGGTGACTAATGCTGGTAAGCATCTTTTAAGGTACTTTTTGGCCAGTTGTATATTTTCTGTGAA
GTGGCTGTCAAATCTTTTGCCCACTTTTAATTGGATTGTTTGTCTTATTGAGTTGTAAAAGTTCTTTATATATACTGTATTAAAGTCCTTTGTAAGACA

Loop counts:

4 nts: 1

Tetra-loop variants:

CUAU    1

Single bulge variants:

G x 0 bulge: 1
A x 0 bulge: 0
U x 0 bulge: 0
C x 0 bulge: 0

1 x 1 internal loop variants:

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